1982年1月22日，时任中共中央总书记胡耀邦同志致信当时的江西省委领导，对赣南大力发展脐橙生产进行了指示，使赣南人民走上了“在山上再造一个赣南”的脱贫致富之路。2006年，依托赣南师范大学、赣州市果业局、赣州市柑橘研究所组建了赣南脐橙工程技术研究中心，2008年获批江西省脐橙工程技术研究中心，2013年4月经科技部批准同意立项组建国家脐橙工程技术研究中心。

目前，“中心”涵盖了育种与栽培技术、病虫害防控技术、商品化处理技术与装备研发、贮藏保鲜与资源综合利用、电子商务与信息化技术等五个研究领域。中心现有研究与试验发展人员280余人，其中研发人员260余人，高级专家16人；博士140余人；汇聚国家级人才6人，省部级人才22人；涌现出“全国优秀科技工作者”“中国质量奖提名奖”等先进典型，先后获“全国专业技术人才先进集体”“全国工人先锋号”“全国教育系统先进集体”等国家级荣誉。中心拥有科研用房总面积1.42万平方米，温网室3.50万平方米，脐橙种质资源圃310亩，高标准示范园3120亩。仪器设备1150余台，原值1.25亿元，包括激光共聚焦、扫描电镜、电感耦合等离子体质谱仪、高效液相色谱仪、果蔬智能分选装备等642台大型先进设备。

中心以“问题导向、平台支撑、协同创新、全链转化”为核心的运行体系，紧密围绕产业实际需求，通过系统化的研发攻关与高效的成果转化，取得了良好效果，2018年中心以优秀成绩通过科技部验收。近5年承担了国家重点研发计划项目等国家级科研项目100余项、省部级科研项目200余项。选育了7个脐橙新品种，牵头制定国家标准2项及行业、地方标准20余项，获江西省科技进步一等奖、全国农牧渔业丰收奖一等奖等13项奖励；授权国家发明专利200余项。累计推广新技术示范应用700余万亩，新品种推广面积40余万亩，新增产值超过136亿元。培训技术人员超4万人次，为全国脐橙产业输送专业技术骨干3000余人，助力脐橙产业带动农村劳动力就业200余万人。

中心将始终坚持“高效、开放、联合、发展”的原则，充分利用现有的科研人才、技术等综合优势及基础条件，使“中心”成为脐橙产业技术的创新中心，转化中心，辐射中心及人才培训基地。